由指揮官展瀚韜領導的飛虎隊行動組A Team，經過一年的合作和鍛煉，各隊員漸漸成熟，合作更具默契，而面對的新挑戰也接踵而來。隨著舊拍檔相繼離隊，俞學禮等A Team成員搖身一變成大師兄，以身作則帶領一批新隊員。大家都認定瀚韜是總督察的最佳人選，但最后總督察卻由潘子龍擔任，眾隊員大表詫異之余，更要重新適應子龍的新作風。
　　瀚韜的最佳拍檔、飛虎隊狙擊手莊卓源與女友丁慧慧彼此認定為終身伴侶，慧慧為支持卓源、深入了解卓源的工作，竟辭去空姐一職。卓源感情生活穩定，但工作上卻遇到瓶頸。另一邊，一心想成為女飛虎的蘇文強，經過多重辛苦訓練，終如愿所長。文強與學禮日久生情，二人正要確認彼此關系時，又出現了感情的牽絆。
　　飛虎隊每次行動部署精密，但在一次行動中，一名飛虎隊員卻被指違反守則。其他隊員團結一致保護犯錯隊友，惟瀚韜公正不阿。向來團結的A Team面臨四分五裂，瀚韜將如何化解危機？
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